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Neuerscheinungen 2014

Stand: 2020-02-01
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Adonney All de Oliveira Veras, Rommel Ramos, Artur Silva (Beteiligte)

AutoAssemblyD


Interface gráfica para montagem de genomas
2014. 64 S. 220 mm
Verlag/Jahr: NOVAS EDICIOES ACADEMICAS 2014
ISBN: 3-639-69228-4 (3639692284)
Neue ISBN: 978-3-639-69228-0 (9783639692280)

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As tecnologias de sequenciamento de segunda gera‡Æo proporcionaram um grande avan‡o dos estudos genômicos, tornando sua utiliza‡Æo um marco que revolucionou a biologia. Estas plataformas sÆo caracterizadas pela redu‡Æo no tempo de sequenciamento, alta produ‡Æo de dados e baixo custo por base sequenciada, contudo, estes equipamentos em sua maioria produzem dados compostos por leituras curtas o que representa um grande desafio para reconstru‡Æo do genoma, devido a essa nova característica das leituras ferramentas computacionais tiveram que ser desenvolvidas para realizar a tarefa de montagem. No entanto, a maioria destes aplicativos sÆo executados através de linhas de comandos extensas compostas por vários parâmetros e devem obedecer a uma sintaxe adequada a sua utiliza‡Æo, pois em caso de erros existe a possibilidade de nÆo obten‡Æo do melhor resultado, com o intuito de resolver este problema apresentamos o AutoAssemblyD que além de proporcionar a utiliza‡Æo destes montadores através de uma interface gráfica também possibilita a gerência destas execu‡äes de forma remota.
Possui gradua‡Æo em tecnologia em processamento de dados, com especializa‡Æo em Redes de Computadores e Mestrado em Biotecnologia (ICB/UFPA), com experiência em gerenciamento de rede de computadores. Atualmente doutorando em bioinformática (UFPA), com montagem de genomas procariotos e desenvolvimento de sistemas para bioinformática em JAVA(J2SE).