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Neuerscheinungen 2017

Stand: 2020-02-01
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Fabricio Araujo

Simulac a o de dados de experimentos de mapping by sequencing


Um pipeline de simulac a o de dados de experimentos de mapping by sequencing em Arabidopsis thaliana
2017. 60 S. 220 mm
Verlag/Jahr: NOVAS EDICIOES ACADEMICAS 2017
ISBN: 3-330-77113-5 (3330771135)
Neue ISBN: 978-3-330-77113-0 (9783330771130)

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Avanc os recentes nas tecnologias de sequenciamento de nova gerac a o (NGS) reduziram o tempo necessa rio para a identificac a o de mutac o es em gene tica forward, uma das principais formas para caracterizac a o da func a o de genes em plantas. A metodologia utilizada para a identificac a o de mutac o es induzidas por agentes mutage nicos fi sicos ou qui micos em uma populac a o de mapeamento e conhecida como mapping-by-sequencing. Dentre as va rias te cnicas que utilizam esta metodologia, Next-generation mapping (NGM) ganha destaque por necessitar de um nu mero pequeno de mutantes na populac a o de mapeamento. Entretanto, nos trabalhos publicados, na o fica claro o porque da utilizac a o dos para metros usados para formac a o da populac a o de mapeamento (nu mero de indivi duos, nu mero de mutantes, forma de cruzamento) e para o sequenciamento (plataforma utilizada, me todo de sequenciamento, cobertura) nos experimentos. Por isso, desenvolveu-se um pipeline de bioinforma tica que possibilita a simulac a o de dados de experimentos que utilizam a te cnica de NGM com a planta modelo Arabidopsis thaliana, uma das plantas mais estudas e sequenciadas na literatura.
Possui gradua‡Æo em Sistemas de Informa‡Æo pela Universidade Federal do Pará (2010) e mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Federal do Pará (2016). Atualmente é bolsista de doutorado da Universidade Federal do Pará. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformatica.